Agra’ya ayak basıldığında ilk olarak gezilecek en önemli nokta Moğol imparatoru Ekber’in anıt mezarı olan Sikandra Fort. 1542–1605 seneleri arasında yaşamış olan Ekber, Hindistan'a hükmeden Babürlüler devletinin en büyük imparatorudur. Cengiz Han ve Timur'un soyundan gelen Ekber, 1556 senesinde daha 14 yaşındayken tahta çıkmıştır. 18 yaşına bastığı gibi iktidarı ele almış ve Hindistan’a egemen olmak için seferlere başlamıştır. Bu seferler tam 40 sene sürmüş,  1601 senesinde amacına ulaşmış ve Hindistan’ı ele geçirmiştir.

Ekber’in ömrü bu sarayın tamamlanmasına yetmemiştir. Ekber, 16 Ekim 1605’te Agra’da vefat etmiştir. Bunun üzerine oğlu Cihangir tarafından planların bazı bölümleri değiştirilerek tamamlanmış ve babasının anısına yapımını bitirdiği sarayı da babasının son mekânı olarak seçmiştir. Bu nedenle Ekber’inmezarı da bu sarayın içinde yer almaktadır.