İstihbarat birimlerinin tespitlerine göre, darbe girişiminin bastırılması üzerine de umduğunu bulamayarak bulunduğu noktadan ayrıldı. Darbe başarılı olsaydı iddiaya göre Zekeriya Öz, darbe yönetiminin Paralel Yapı dosyaları ile ilgili tersine başlatılacak soruşturma sürecini yönetecekti. Meslekten men edilen Zekeriya Öz, diğer eski savcı Celal Kara ile birlikte 1 yıl kadar önce yurtdışına firar etmişti.